基因突變文庫合成
基因突變文庫是大量DNA變體序列的組合,是基因合成、基因突變和定向進化研究相結合的產物。通用生物提供的基因突變文庫服務,可根據您的要求僅突變指定的氨基酸或核苷酸序列,同時保證文庫的容量、多樣性和完整性,可用于蛋白抗體文庫的構建與篩選。

可提供突變引物庫種類:

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Trimer簡并引物

使用單一核苷(monomer)合成的簡并引物,在突變位點會不可避免的產生冗余突變和終止密碼子。將三個核苷按固定順序連接起來所形成的三聯核苷(Trimer Phosphoramidites)可以對應單一的氨基酸。以Trimer混合物作為元件設計的簡并引物,能夠保證突變位點的氨基酸按照設計的比例構成,滿足特定位點的氨基酸多樣性和偏好性。

Trimer與氨基酸對照表

Amino Acid
Abbreviaiom
Lys
K
Asn
N
Thr
T
Ile
I
Met
M
Gln
Q
His
H
Pro
P
Arg
R
Leu
L
Glu
E
Asp
D
Ala
A
Gly
G
Val
V
Tyr
Y
Swr
S
Cys
C
Trp
W
Phe
F

示例:

5GCAACTTATTACTGTCAGCAA(X)5-8CYGWTCACGTTCGGACAGGG3

X Trimers=Y(50%)/S (10)/G(10)/A(5)/F(5)/W(5)/H(5)/P(5)/V(5)


IUBcode簡并引物

通過混合2-4種堿基,核苷代碼由單一的A、T、C、G拓展到R、Y、......N11種混合核苷代碼(IUB code)。使用IUB code構建不同的密碼子組合,可以在突變位點形成固定氨基酸的組合。

IUBcode密碼對照表

IUBcode
Mixed Bases
R
A、G
Y
C、T
M
A、C
K
G、T
S
C、G
W
A、T
H
A、C、T
B
C、G、T
V
A、C、G
D
A、G、T
N
A、C、G、T


 

NNK簡并引物

NNK簡并密碼子包含了32種密碼子組合,覆蓋了所有20種氨基酸殘基,是構建文庫常用的簡并密碼子。

示例

5GGCCCTAACGGATAACCG(NNK)6GCCAATTCATGCACCTTACG3

N=A/C/G/T, K =G/T


服務優勢
    1. 1、無需DNA模板,只需提供序列信息
    2. 2、超高的突變精確性、更豐富的文庫多樣性
    3. 3、更大的文庫容量,更高的篩選成功率
    4. 4、獲得利用傳統突變方法無法獲得的基因變異體
服務說明
    質量控制:
    1、線性DNA文庫:PCR產物文庫,將該文庫連接至特異性載體上,隨機挑取12-96個克隆測序,從而確定該文庫的多樣性和準確率
    2、質粒DNA文庫:將線性DNA文庫裝至客戶指定載體上所得到的克隆文庫,隨機挑取12-96個克隆進行測序,從而確定該文庫的多樣性和準確率
服務流程
    文庫設計---突變引物庫合成----質粒DNA文庫構建(或線性DNA文庫構建)----質量控制----交付質粒DNA文庫或線性DNA文庫。
服務訂購
1、1-2μg線性DNA文庫或5-10μg質粒DNA文庫的凍干樣品
2、發送文件,包括原始測序譜圖、QC文件(線性DNA文庫或質粒DNA文庫電泳圖、酶切圖和序列比對圖)以及COA文件
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